Церковь Николая Чудотворца в Рубленом городе — старинный храм, сохранивший с XVII века до наших дней свой первозданный вид. Он по праву считается одной из самых гармоничных и красивых православных достопримечательностей Ярославля. Храм возведен в 1695 году на деньги посадских людей — владельцев судоверфей, в честь покровителя моряков Святого Николая. Расположен в самом сердце города, на берегу реки Которосли. По преданию, на этом месте ранее находилась древняя деревянная надвратная часовня, построенная еще Ярославом Мудрым на входе в деревянный кремль, так называемый «рубленый город». Страшный пожар уничтожил кремль задолго до строительства святыни (в 1658 году), но название его осталось в веках.
Уникальность церкви Николы Рубленого в Ярославле заключается в ее почти аскетичной простоте. Изящный, выразительный, гармоничный каменный Никольский храм построен безо всякой вычурности и словно устремлен ввысь, к небесам. Все детали трактованы в виде геометрических фигур, придающих строению совершенную пропорциональность. Фасады весьма скромные, практически не имеют украшений: глубокие окна в глубоких нишах, гладкие карнизы. Лишь колокольня является исключением: в шатре видны люкарны — оконные проемы, украшенные нарядными наличниками и красивые арки на ярусе звона.
Композиция Церкви Николы Рубленый Город, составлена из пятиглавого четверика, высокой шатровой колокольни и низкой трапезной. В трапезной находился придел Александра Свирского, который позже переоборудовали в теплую церковь. В отличие от приходских культовых сооружений, возводившихся в то время, зимний и летний храмы, колокольня представляют единое пространство. Впоследствии многие сельские приходы строили здания по подобному образцу. Стройная колокольня расположена на высоком арочном крыльце, ведущем в основное здание. С юга к колокольне примыкает открытое крыльцо на 8-мигранных столбиках. Тяжелое и громоздкое, крытое двускатной крышей, оно подчеркивает легкость основной постройки. С востока к храму Николая Чудотворца прилегает единственная апсида. Изначально главы были выложены зеленой черепицей, и в настоящее время такое покрытие восстановлено, хотя в XIX веке, исходя из соображений экономии, их крыли железом.
В 1918 году, во время вооруженного восстания, Храм Николы Рубленого был сильно поврежден артиллерийскими обстрелами. После незначительной реконструкции, спасшей памятник раннего ярославского зодчества от полного разрушения, он был закрыт для прихожан. Долгое время строение пустовало, и лишь в 1980 годы в нем расположили реставрационные мастерские Ярославского художественного музея.